Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP43Q70EL4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP43Q70EL4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP43Q70EL4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP43Q70EL4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP43Q70EL4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP43Q70EL4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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