Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms