Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms