Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms