Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms