Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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