Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms