Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms