Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms