Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms