Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SBK1Q52WX2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms