Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms