Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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