Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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