Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms