Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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