Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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