Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK5Q16478 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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