Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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