Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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