Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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