Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME4Q14997 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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