Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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