Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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