Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms