Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME3Q13232 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME3Q13232 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms