Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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IFT88Q13099 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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IFT88Q13099 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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IFT88Q13099 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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IFT88Q13099 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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