Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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