Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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