Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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