Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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