Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP1B1Q10567 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms