Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms