Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms