Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms