Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBQ06643 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms