Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms