Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN1Q04323 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms