Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms