Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COG7P83436 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG7P83436 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG7P83436 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG7P83436 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms