Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-24P63145 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms