Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms