Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms