Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 549.7 ms