Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A2P55011 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms