Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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