Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms