Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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