Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms