Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms